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  • LEfSe差异分析 LEfSe是一种用于发现高维生物标识和揭示基因组特征的软件。包括基因,代谢和分类,用于区别两个或两个以上生物条件(或者是类群)。该算法强调的是统计意义和生物相关性。让研究人员能够识别不同丰度的特征以及相关联的类别。
  • 分级发育树 数据库中包含微生物的分类学系统关系树。在前述分类学分析中,已经得到了每个OTU 的丰度和对应的分类学信息,将测序得到的物种丰度信息回归至数据库的分类学系统关系树中,可以从整个分类系统上了解测序的环境样品中所有微生物的进化关系和丰度差异。
  • 环形发育树 在分子进化研究中,系统发生的推断能够揭示出有关生物进化过程的顺序,了解生物进化历史和机制,可以通过序列间碱基的差异构建进化树。选择OTU的代表序列根据邻位比对法(neighbor-joining)构建进化树,结果可以用列图或者圈图的形式呈现。
  • 微生物间相互关系 相关性分析是用于分析微生物间相互作用关系的经典方法,可甄别出微生物群落间(包括**、**、古**等各类检测目标)具有显著相关性、强相关、正相关、负相关的各项。
  • 网络分布图 网络图可以形象的展示不同样本或组之间物种的丰度情况,不同颜色代表不同样本,中间的交叉节点代表不同的物种,节点的面积代表物种丰度。
  • 客户定制分析绘图 客户定制分析绘图是可同时开展Illumina MiSeq、Ion PGM、Roche 454等平台进行高通量测序分析,PacBio第三代高通量测序分析,PCR-DGGE变性梯度凝胶分析,实时荧光定量PCR(Real-time qPCR),克隆文库等多种微生态分析方法的公司。

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